Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 MEF2C-AS1-206ENST00000511100 828 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC011632.1-203ENST00000522914 454 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC006557.1-201ENST00000591211 1085 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 KCNIP4-204ENST00000382150 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 SERPINA9-201ENST00000298845 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 AC073987.1-201ENST00000422683 638 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 TUBD1-206ENST00000539018 1027 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 LINC02246-207ENST00000630354 524 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXB3P14651 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms