Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM27P14373 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms