Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms