Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODC1P11926 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODC1P11926 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ODC1P11926 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ODC1P11926 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ODC1P11926 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ODC1P11926 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms