Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms