Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZBED1O96006 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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