Protein–RNA interactions for Protein: O95049

TJP3, Tight junction protein ZO-3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TJP3O95049 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TJP3O95049 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TJP3O95049 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TJP3O95049 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TJP3O95049 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TJP3O95049 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TJP3O95049 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TJP3O95049 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TJP3O95049 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TJP3O95049 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TJP3O95049 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TJP3O95049 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TJP3O95049 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TJP3O95049 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TJP3O95049 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TJP3O95049 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TJP3O95049 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TJP3O95049 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TJP3O95049 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TJP3O95049 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TJP3O95049 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TJP3O95049 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TJP3O95049 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TJP3O95049 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TJP3O95049 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TJP3O95049 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TJP3O95049 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TJP3O95049 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TJP3O95049 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TJP3O95049 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TJP3O95049 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TJP3O95049 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TJP3O95049 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TJP3O95049 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TJP3O95049 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TJP3O95049 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TJP3O95049 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TJP3O95049 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TJP3O95049 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TJP3O95049 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TJP3O95049 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TJP3O95049 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TJP3O95049 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TJP3O95049 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TJP3O95049 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms