Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms