Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VWA8A3KMH1 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms