Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC78A2IDD5 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC78A2IDD5 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms