Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK1Q9UPV9 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAK1Q9UPV9 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAK1Q9UPV9 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAK1Q9UPV9 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAK1Q9UPV9 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAK1Q9UPV9 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAK1Q9UPV9 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAK1Q9UPV9 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAK1Q9UPV9 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAK1Q9UPV9 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAK1Q9UPV9 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAK1Q9UPV9 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAK1Q9UPV9 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAK1Q9UPV9 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAK1Q9UPV9 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAK1Q9UPV9 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAK1Q9UPV9 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAK1Q9UPV9 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAK1Q9UPV9 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAK1Q9UPV9 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAK1Q9UPV9 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAK1Q9UPV9 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAK1Q9UPV9 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAK1Q9UPV9 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAK1Q9UPV9 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms