Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms