Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms