Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CPA4Q9UI42 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms