Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX61

TMEM161A, Transmembrane protein 161A, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM161AQ9NX61 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM161AQ9NX61 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM161AQ9NX61 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM161AQ9NX61 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM161AQ9NX61 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM161AQ9NX61 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM161AQ9NX61 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
TMEM161AQ9NX61 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
TMEM161AQ9NX61 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM161AQ9NX61 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms