Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMILIN3Q9NT22 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EMILIN3Q9NT22 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms