Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms