Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM5Q9NQX1 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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