Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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