Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRIP3Q9BW71 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms