Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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C9orf16Q9BUW7 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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C9orf16Q9BUW7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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C9orf16Q9BUW7 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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C9orf16Q9BUW7 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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C9orf16Q9BUW7 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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C9orf16Q9BUW7 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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C9orf16Q9BUW7 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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