Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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CENPOQ9BU64 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CENPOQ9BU64 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPOQ9BU64 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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