Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NICN1Q9BSH3 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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