Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms