Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms