Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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