Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SGCZQ96LD1 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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