Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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