Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms