Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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