Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NUP35Q8NFH5 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms