Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBP7

PCSK9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK9Q8NBP7 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms