Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC50Q8IVM0 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms