Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 AAK1-201ENST00000406297 4499 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 GAB2-201ENST00000340149 6052 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 ATP8A1-202ENST00000381668 8270 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 RALGPS2-203ENST00000367634 7512 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 ARHGAP36-203ENST00000370922 2736 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 BIVM-ERCC5-204ENST00000639132 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 TRAF3-201ENST00000347662 7700 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 GRM8-201ENST00000339582 4057 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 LRTM2-208ENST00000543818 3986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 SHMT2-201ENST00000328923 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 RIN2-201ENST00000255006 4505 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 AL592490.1-201ENST00000409186 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HRCT1Q6UXD1 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms