Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CXCL17Q6UXB2 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CXCL17Q6UXB2 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CXCL17Q6UXB2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CXCL17Q6UXB2 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CXCL17Q6UXB2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CXCL17Q6UXB2 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CXCL17Q6UXB2 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CXCL17Q6UXB2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CXCL17Q6UXB2 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CXCL17Q6UXB2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CXCL17Q6UXB2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CXCL17Q6UXB2 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CXCL17Q6UXB2 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL17Q6UXB2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL17Q6UXB2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL17Q6UXB2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL17Q6UXB2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL17Q6UXB2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CXCL17Q6UXB2 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL17Q6UXB2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL17Q6UXB2 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL17Q6UXB2 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL17Q6UXB2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL17Q6UXB2 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL17Q6UXB2 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL17Q6UXB2 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL17Q6UXB2 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL17Q6UXB2 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL17Q6UXB2 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL17Q6UXB2 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL17Q6UXB2 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL17Q6UXB2 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL17Q6UXB2 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL17Q6UXB2 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL17Q6UXB2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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