Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL3Q6DD88 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms