Protein–RNA interactions for Protein: Q5RL73

RBM48, RNA-binding protein 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM48Q5RL73 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RBM48Q5RL73 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RBM48Q5RL73 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RBM48Q5RL73 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RBM48Q5RL73 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RBM48Q5RL73 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RBM48Q5RL73 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RBM48Q5RL73 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RBM48Q5RL73 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RBM48Q5RL73 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RBM48Q5RL73 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RBM48Q5RL73 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RBM48Q5RL73 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RBM48Q5RL73 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RBM48Q5RL73 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RBM48Q5RL73 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RBM48Q5RL73 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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