Protein–RNA interactions for Protein: Q4JDL3

PTPN20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN20Q4JDL3 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN20Q4JDL3 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms