Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MICAQ29983 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MICAQ29983 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MICAQ29983 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MICAQ29983 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MICAQ29983 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms