Protein–RNA interactions for Protein: Q17RN3

FAM98C, Protein FAM98C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM98CQ17RN3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM98CQ17RN3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms