Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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CDO1Q16878 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDO1Q16878 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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