Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CDKN3Q16667 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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