Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FSCN1Q16658 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms