Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
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