Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNGA3Q16281 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CNGA3Q16281 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CNGA3Q16281 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CNGA3Q16281 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CNGA3Q16281 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CNGA3Q16281 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CNGA3Q16281 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CNGA3Q16281 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CNGA3Q16281 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CNGA3Q16281 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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