Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC6Q16204 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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