Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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