Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms