Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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