Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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LAPTM4AQ15012 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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LAPTM4AQ15012 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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LAPTM4AQ15012 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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LAPTM4AQ15012 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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LAPTM4AQ15012 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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LAPTM4AQ15012 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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